高粘度齒輪泵的支座或法蘭與其驅動電機應采用共同的安裝基礎，基礎、法蘭或支座均需具有足夠的剛度，以減小齒輪泵運轉時產生的振動和噪聲。電動機與齒輪泵須用彈性聯軸器連接，同軸度小于0.1毫米，傾斜角不得大于1度。安裝聯軸器時不得用錘敲打，以免傷害齒輪泵的齒輪等零件。若用帶輪、鏈輪等驅動時應設托架支承，以防主動齒輪軸承受徑向力。緊固齒輪泵、電動機的地腳螺釘時，螺釘受力應均勻，連接可靠。用手轉動聯軸器時，應感覺到齒輪泵能夠輕松地轉動，沒有卡緊等異常現象出現，然后才可以配管。高粘度齒輪泵的吸油管道內徑應足夠大，并避免狹窄通道或急劇拐彎、減少彎頭，去除不必要的閥門、附件，盡可能地降低泵的安裝高度，縮短吸油管道的長度，以減少壓力損失。管接頭等元件的密封要良好，以防止空氣侵入，從而控制氣穴與氣蝕的發生。
在開始運轉前，往齒輪泵的殼體內灌滿待輸送的液體，便于安全啟動。若環境溫度低于冰點，應預先向泵內通入熱蒸汽，進行預熱處理，然后才可啟動齒輪泵。齒輪泵的旋轉方向要與進、出油口相符。齒輪泵若是第一次運行，或長期閑置后再使用，最好在空載或小負荷情況下先跑合一小時左右。如果在跑合階段預先覺察出異常溫升、泄漏、振動和噪聲時，應停機檢查。
止回閥與安全閥在齒輪泵的輸出管路上最好安裝一個止回閥。這樣在檢修泵及輸出管道時，系統中的液體不會發生倒流。齒輪泵帶負荷停車時，亦可防止泵倒轉而在其輸出管道內產生局部真空。應當注意，出口止回閥不能裝反或出現卡死現象。高粘度齒輪泵的出口管路上還應當設置安全閥等保護裝置，這樣一旦泵的出口通道發生堵塞，就可以打開安全閥卸壓。安全閥可以與泵體或泵蓋鑄成一體，也可以單獨裝配。對于需要正反轉的高粘度齒輪泵，其進出口管路上均需設置安全閥。